Более 400 000 пользователей за последние две недели загрузили специальное приложение с серверов проекта «Folding @ Home», основанного Вашингтонским университетом в Сент-Луисе. Усилия по «распределенным вычислениям» объединяют тысячи устройств для создания виртуального суперкомпьютера.
Проект, начатый в Стэнфордском университете 20 лет назад, был разработан для использования вычислительной мощности краудсорсинга с целью моделирования, аномалий «сворачивания белка», которые могут приводить к гибели патогенных микроорганизмов. С помощью полученных в распоряжение вычислительных мощностей ученые осуществляют поиск «карманов» или «дыр» в вирусе, в которые можно втиснуть лекарства.
«Моделирование позволяет нам наблюдать за движением каждого атома во времени», — сказал руководитель проекта профессор Грег Боуман. «Наша главная цель – поиск мест на вирусе, куда будет направлено лечение».
Цели для лекарств
Привлеченные вычислительные мощности позволяют проверить возможности потенциальной лекарственной терапии. Данная методика известна как компьютерная разработка лекарств.
Боуман рассказал, что с оптимизмом смотрит на эти усилия, поскольку ранее таким же образом была найдена «лекарственная» мишень на вирусе Эбола и потому, что COVID-19 структурно похож на вирус SARS (вирус атипичной пневмонии 2002-2003года), который ранее также был предметом многих исследований.
«Самое лучшее — это найти в ближайшем будущем уже существующий препарат, который можно будет связать с одним из этих мест на вирусе», — сказал он. — «Если это произойдет, это может быть использовано сразу».
Вероятнее всего, к таким препаратам относятся противомалярийные средства хлорохин и гидроксихлорохин, которые могут быть «перенаправлены» для лечения COVID-19.
По словам ученого, проект смог увеличить свою мощность примерно до 400 петафлопс, причем каждый петафлоп способен выполнять один квадриллион вычислений в секунду, или в три раза мощнее, чем ведущие суперкомпьютеры мира.
Параллельно подобные работы выполняются и на других суперкомпьютерах. Ранее ученые из Национальной лаборатории Ок-Риджа заявили, что, используя самый мощный суперкомпьютер IBM, обнаружили 77 потенциальных мест для связывания с основным белком коронавируса, чтобы обезвредить его.
Вычислительные мощности безграничны
Проект «Folding @ Home» поддерживается мощными вычислительными ресурсами настольных компьютеров, ноутбуков и даже консолей PlayStation, а также более мощными промышленными компьютерами и серверами. Свои ресурсы предоставили ряд крупных IT компаний, включая GitHub, принадлежащий Microsoft. Ведутся переговоры и с другими возможными партнерами.
Любой человек, у которого есть относительно новый компьютер, может внести свой вклад, установив приложение, которое загружает небольшое количество данных и проводит их анализ. Участники могут выбирать, над каким заболеванием они хотят работать.
«Это похоже на добычу биткойнов, но на службе человечества», — сказал Квентин Роадс-Эррера из фирмы Critical Start, занимающейся вопросами компьютерной безопасности, которая предоставила проекту свой мощный компьютер, предназначенный для взлома и дешифрования паролей.
Битва с беспомощностью
Производитель компьютерных чипов Nvidia, выпускающий мощные графические процессоры для игровых устройств, призвал геймеров также присоединиться к этой работе.
«Реакция была удивительной, с десятками тысяч новых пользователей», — заявил представитель Nvidia Эктор Маринез.
Один из крупнейших вкладов вносит группа энтузиастов и геймеров Reddit, в которой участвуют около 24 000 участников.
«Это фантастическое оружие против чувства беспомощности», — сказал Педро Валадас, юрист из Португалии, возглавляющий сообщество Reddit и являющийся участником консультативного совета проекта. — «Тот факт, что каждый, дома, с компьютером, может сыграть свою роль и помочь в борьбе с (болезнями) для общего блага, является мощным заявлением».
